采购公告-免疫规划检测项目测序服务2024-FW-003（重）一、采购项目名称及内容采购人：广西壮族自治区疾病预防控制中心；采购项目名称：免疫规划检测项目测序服务；项目编号：2024-FW-003（重）

一、采购项目名称及内容

采购人：广西壮****中心；

采购项目名称：免疫规划检测项目测序服务；

项目编号：2024-FW-003（重）；

资金来源：财政资金。

二、项目内容

（一）菌株全基因组测序：30次。

1．样本类型：纯化后的灭活细菌。

2．DNA提取：采用SDS或STE的方法对样本的基因组DNA 进行提取，之后利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA 的纯度和完整性，利用Qubit进行定量。

3．文库构建：经电泳检测合格的DNA 样品用 Covaris 超声波破碎仪随机打断成长度约为350bp的片段。处理完成后的DNA片段，使用 NEBNext®Ultra™ DNA Library Prep Kitfor Illumina(NEB, USA)试剂盒，经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。

4．文库检测：文库构建完成后，先使用Qubit 2.0 进行初步定量，稀释文库至 2ng/ul，使用 Agilent对文库的插入片段进行检测，insert size符合预期后，使用 Q-PCR 方法对文库的有效浓度进行准确定量，以保证文库质量。

5．***平台：使用illumina NovaSeqPE150上机测序，运行智能化交付系统和自动化样本库系统；

6．数据质量：原始下机数据测序质量要求: Q20≥90%，Q30≥85%；

7．数据量：raw data≥1G/样本；

8．数据交付：需要交付clean data；

9．周期要求：需要保证项目可加急得到响应，二代测序仪充足≥15台；

10．生物信息学分析内容：

① 原始下机数据处理:过滤测序质量值低的reads，保留高质量reads，得到Clean Data；

② 样品组装: 进行基因组组装，得到能反映样品基因组基本情况的序列文件，并对组装结果进行评价；

③ 基因组组分分析组装完成后，分析样品基因组的成分，包括编码基因、非编码RNA、重复序列、前噬菌体、基因岛、CRISPR等基因组成分的预测；

④ 功能注释针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释，包括常用的KEGG、COG数据库、针对病原微生物的数据库；

⑤ 基因组比较分析此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异，包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。

（二）一代测定服务：400反应。

1．样本为PCR产物和引物，PCR产物未纯化，引物浓度为20μM。

2．★一代测定服务包括：序列测定在技术服务公司实验室完成，对PCR产物纯化，并按照送样者要求的长度进行基因序列测定。将测序结果以图谱形式反馈。

3．★ PCR产物纯化方式：胶回收纯化。

4．测序要求：双向或者单向，送检单会标明。

5．测序序列质量：一个正常的成功反应，能保证测序色谱图文件（*.abi） 峰形清晰，无杂峰，峰值明显。

6．★提供的结果为：测序色谱图文件（*.abi）、终序列、拼接序列（*.fas或*.fasta）。结果反馈地点及数量：按照采购方要求发往指定服务地点。

7．检测中使用的试剂和耗材均需为优质无菌。

8．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。

9．★服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。

10．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮****中心不定期进行标本交接。

11．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。

（三）提供的成果

包含但不限于：出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单。

（四）提交服务成果时间

收到样本并质检合格后，一代测定服务于3～8个工作日内完成检测并返回结果；菌株全基因组测序于30个工作日内完成所有项目分析内容。售后服务包括能提供现场报告解读。若样本未检出或峰图有杂峰等无法分析，重测也如此，视为此次测序无效，采购方将不支付相应费用。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用，并追究样本损失。

（五）其他要求：

1．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。

2．★ 服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。

3．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮****中心不定期进行标本交接。

4．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。

① PCR产物测序使用的试剂应具备中华人民共和国医疗器械注册证（体外诊断试剂）或者为成熟的商业化试剂盒，使用的测序仪应具备中华人民共和国医疗器***平台。

② 实验过程必须严格按照试剂说明书进行操作；在PCR产物质量过关的前提下，中标供应商须对每批样本测序实验进行质控，不可出现实验交叉污染、样本弄混等严重错误；出现此类错误导致的一切成本损耗皆由其负责。

③ 参与投标的供应商须具备纯化PCR产物的能力，并保证PCR产物符合测序要求；接收到待检样本后至建库测序数据产出，应有严格的质控标准；具有短期处理大量样本，进行一代测序的经验；不得将测序服务转包第三方公司。

④ 样本收取及运输管理：按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌（毒）种或样本运输管理规定》的运输管理规范进行标本运输，根据采购人指定的时间、地点，由中标供应商上门收样后将样本运回实验室。

⑤ 采购人对检测调查结果拥有所有权，供应商对检测调查结果负有保密义务，仅提供给采购人或采购人指定的人员；未经采购人许可，不得对第三方泄露检测信息，不得在报刊杂志上发表或作其他任何用途的引用。

⑥ 中标供应商应在样本接收后及时对PCR产物进行质检，将结果反馈给采购人；所有未使用完的样本应免费保存至少1个月，并在必要时返回原样。剩余样本未经采购人同意不能将另作他用、转让给第三方使用或应按照相关规定高压后处理。

（六）服务地点：检测服务在中标供应商的实验室内完成。

（七）采购预算：3.14万元，其中菌株全基因组测序为700元/株、一代测定为26元/反应。

（八）报价要求：包括：服务的价格；必要的保险费用和各项税金；运输、装卸、安装、调试、培训、技术支持、售后服务、税金及其它所有成本费用的总和。

采购项目的名称、数量、简要规格描述详见附件报价表，须用使用统一格式报价表，否则投标无效。

（九）付款条件：按中标实际单价、实际检测并验收合格的份数进行结算。

（十）采购结果认定：满足采购需求的前提下最低价中标，超出预算的投标视为无效。

二、资格要求及条件

1.投标人须是国内注册企事业单位，拥有独立法人资格，具有有效的营业执照、税务登记证、组织机构代码、技术服务许可证。

2.检测实验室必须已开展测序服务实验（提供复印件，原件备查）并承诺独立完成本项目，不得转让或转包或分包。

3.投标人须符合《政府采购法》第二十二条规定的条件；

4.投标人在“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）查询相关供应商主体信用记录，将查询结果加盖投标人单位公章提交（必须提供，如为事业单位及高校可不提供）；

5.服务工作周期：签订合同之日起到2025年5月31日。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用。

6.具有履行合同所必需的人员和专业服务能力；

7.国家法律、法规规定的其他要求；

8.验收方式：

供应商提供的成果包含提供的成果包含出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单等进行验收。

9.付款方式

按实际检测份数及项目报价单价结算，采购人收到并对结果无异议，凭验收单中的检测实际数量，根据供应商开具相应发票，在10个工作日内支付全部的费用。采购人对发票有异议的，应在收到发票后3日内向供应商提出异议，双方协商解决。

10.其他：应统一按附件报价表进行报价，不能恶意低价投标。

11.投标人根据报价表填写拟采购项目相关信息及价格一同密封提交（资格要求及条件材料装订成册）。闭封袋密封处需加盖递交单位公章，密封文件袋封面须注明产品名称，递交公司全称（信封密封口盖骑缝章）。

三、投送材料截止时间、地点

1.截止日期：2024年6月12日下午16点；

2.截止地点：****路****号****中心****楼房。采购管理科联系人及电话：蒙婧婷、李杰文0771-***1500。

广西壮****中心

2024年6月5日

2024-fw-003（重）统一报价表.xlsx