广西壮族自治区疾病预防控制中心关于采购自动化基因测序、文库制备和生信分析系统的方案征集

序号

服务名称

服务内容及技术要求

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自动化基因测序、文库制备和生信分析系统1套

一、技术参数： 1.应用范围：可开展eDNA测序、微生物测序、肿瘤靶向测序、小型全基因组测序、低深度全基因组测序及个体识别等多种应用。

2.基因测序仪模块

2.1信号放大原理：采用滚环扩增（RCA）的线性扩增方式扩增文库拷贝数，每轮扩增均以原始文库分子为模板，减少因指数扩增（如桥式PCR，乳液PCR）造成的扩增偏向性与扩增错误积累。

2.2数据通量：单载片运行可满足≥120 Gb数据产出，双载片同时运行可满足≥240 Gb数据产出。

2.3测序方式：自动化单端和自动化双端读取序列，读长≥600bp；可支持 1*100bp、2*150bp、2*300bp等多种读长，并支持以上读长范围内自定义读取长度。

2.4加载系统：测序仪能满足外置样本加载系统的功能。

2.5信号采集模式:双芯片模块设计，支持单芯片测序、双芯片同时测序、双芯片滚动测序、混合读长的双芯片混动测序等多种模式。

2.6支持不少于3种通量规格芯片，规格分别不低于≥40M reads，≥80M reads，≥200M reads。

2.7运行时间：芯片规格≥80M reads，SE100模式下，单次运行时间≤5小时，PE150模式下，单次运行时间≤12小时，PE300模式下，单次运行时间≤30小时，包括：样本加载、测序、碱基识别和数据处理时间。

2.8当选择40M reads载片，100<读长≤300bp时，测序Q30值>90%，测序Q40＞85%。当选择80M reads载片，读长≤300bp时，测序Q30值>90%，测序Q40值>85%，300bp＜读长≤600bp时，测序Q30值>85%，测序Q40值>80%。当选择200M reads载片，读长≤100bp时，测序Q30值>90%，测序Q40值>85%，100<读长≤300bp时，测序Q30值>85%，Q40值>85%，300<读长≤600bp时，测序Q30值>85%，Q40值>80%。

2.9信息分析：测序同时能进行初步数据分析，并产生有质量打分的碱基序列。

2.10产品内搭载实验室管理系统，测序结束即可直接触发分析。

3. 自动化测序文库制备系统模块

3.1可全自动完成样本核酸提取、定量、均一化、文库混合、文库制备、DNA纳米球制备，一步手动转移至基因测序仪即可实现测序全流程。

3.2 建库样本通量≥32例/run。

3.3仪器具备带感应功能的安全防护封闭门，防止非法进入工作台面；在异常开门时会暂停流程。

3.4 HEPA系统：0.3μm过滤效率≥99.995%。

3.5 功能模块包含样本管载架、条码扫描、温控震荡模块、在线PCR模块、定量模块、温控模块、磁力架、固定八通道+独立单通道移液器、板类抓手、HEPA系统及UV紫外。

3.6定量检测方法为荧光染料法，检测范围：0.5−120 ng/uL。

4. 生信分析平台模块

4.1 集成了硬件系统和分析软件，可与基因测序仪关联，支持测序完成后即刻自动分析，并配备专业的实验室信息管理系统，提供图形化操作界面，开机即用。用户可在该平台上分析样本数据，实现从测序下机数据到自动生成报告及分析结果。

4.2 配备从样本制备到分析报告，端到端的全流程解决方案。实验室仪器设备管理与实时监控，样本实验信息记录与追溯，数据传输及管理，分析任务调度及计算，分析结果与报告的管理及可视化展示。

4.3 输入：输入数据格式为常规的 FASTQ 格式。同时支持二、三代测序数据。

4.4 输出：按样本自动生成鉴定报告及分析结果。

4.5 测序结果按照不同分析流程展示对应结果及可视化结果报告。

4.6 具有多个分析流程功能，包括但不限于微生物快速识别，微生物组装溯源；新冠病毒靶向测序分析；呼吸道病毒靶向测序分析流；猴痘病毒组装溯源分析及快速广谱病毒识别分析等。

4.7 数据库覆盖的宿主及病原微生物一起≥48000种，需提供1年≥2次不定期数据库更新。

二、配置清单

1.基因测序仪模块 1套；

2.自动化测序文库制备系统模块 1套

3.生信分析平台模块 1套

4.装机及培训试剂、耗材1套

5.Qubit核酸蛋白定量仪 1台

6.EP管磁力架：4个

7.96孔板磁力架：1个

8.移液器：0.5-2uL单道 （2支）；2-10uL单道（2支）；10-100uL单道（2支）；10-100uL 8道（2支）；100-1000uL 单道（2支）

序号

服务内容

单位

数量

单价报价（元）

1

自动化基因测序、文库制备和生信分析系统

套

1