关于南昌市疾病预防控制中心（市卫生健康综合监督执法局）15份呼吸道多病原体检测阴性样本宏基因组测序服务采购项目通知公告

关****中心（市卫生健康综合监督执法局）

15份呼吸道多病原体检测阴性样本宏基因组测序服务采购项目通知公告

一、采购清单：

注：供应商的报价应包含发生的一切费用。

二、供应商必须提供的询价响应资料：（所有材料必须全部提供，否则视为无效响应。）

1、有效的营业执照副本复印件及其他可适用的证明材料（如有）；

2、法人授权委托书原件；

3、报价函加盖公章；

4、公司需具有相关资质；

5、公司业绩。

6、技术要求响应承诺函（见附件一）

三、供应商其他要求：无。

四、有意向的供应商须在递交询价响应资料截止时间前递交密封的询价响应资料：（所有供应商的询价响应资料必须密封并加盖公司公章）

递交询价响应资料截止时间为：2024年11月15日9:00 （北京时间）。

五、递交地点：****中心****楼。

采购人名称：****中心（市卫生健康综合监督执法局）

采购人地址：****路****号

采购人联系人：徐老师

采购人联系电话：0791-****3275

询价时间：2024年11月11日

附件一

技术要求响应承诺函

****中心（市卫生健康综合监督执法局）：

我公司承诺如中标后将按照以下要求提供服务：

1.服务内容：对符合生物安全的生物样本进行宏基因组测序（二代高通量测序）及后续的数据质控，交付完整原始数据、宏基因组分析数据和报告。

2.服务要求：

（1）服务方提供标本运输保存工具，确保标本不发生降解和溶解；

（2）服务方应对检测内容进行预实验；

（3）宏基因组测序内容：

①核酸（DNA和RNA）质量检测：DNA提取物OD260/OD280在1.7-1.9之间，OD260/OD230在2.0-2.5之间，荧光检测仪检测总DNA量在100ng以上，去宿主处理，1%琼脂糖凝胶电泳测定DNA主带应在400bp以上。RNA提取物的OD260/OD28超过1.8，RNA完整度检测，并进行使用DNase进行处理；

②高通量测序文库构建的技术指标和要求：文库DNA的OD260/OD280在1.7-2.0之间；文库片段大小为插入片段和接头序列的总长度。文库插入片段长度应符合所选测序读长的需求；文库主峰明显、无杂峰、无接头、无引物二聚体。RNA样本转换成双链DNA后进行后续的测序流程；

③测序策略：双端测序，PE150或PE250及以上；

④服务方应采用高通量测序技术进行建库测序，每个样品产生的平均原始数据≥10G，测序数据中Q30以上占比≥85%，最终单份样本reads数目≥50M；

⑤提供送检样本后15个工作日内完成测序和数据交付，并提供后续相关数据质控和分析服务。

（4）测序数据分析内容：

①下机原始数据需进行数据质量过滤，包括过滤测序接头、低质量序列、低复杂度序列、重复序列；

②宿主参考序列数据库：至少包括人类基因组参考序列，且需不仅收录人类染色体基因组，还需包括线粒体等基因组、转录组序列信息；

③物种鉴定：物种鉴定参比数据库中需涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫等微生物，以微生物物种分类注释为目的，微生物种属的种类不得少于Refseq数据库中的微生物种类；推断纳入微生物参考基因组数据库FDA-ARGOS及参考病毒数据库FDA-RVDB；剔除冗余、错误及不完整数据，选择高质量、组装完整的序列。分析工具可以采用基于Kmer算法，也可基于物种特异性基因进行比对；

④毒力基因鉴定：毒力基因参比数据库中基因不得少于VFDB数据库中经实验验证的毒力基因，推荐每年至少更新版本一次；

⑤耐药基因鉴定：耐药基因参比数据库推荐使用CARD或Resfinder或MEGARes数据库，推荐每年至少更新版本一次。

3.报告要求：报告病原体信息原则上准确到种，同时也应包括相应的属信息；报告内容应包括：检测到的所有微生物列表，对应的比对总序列数量、对应的唯一比对序列数量、相对丰度。毒力基因和耐药基因需标明每个基因的测序覆盖度和测序深度。将传染病法中规定需要关注的病原体特殊呈现。同时，报告中还应标明所使用的数据库情况、比对策略说明。

4.服务方对检测资料及数据严格保密，不得对外泄露。