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广州医科大学附属肿瘤医院肿瘤基因高通量测序采购项目调研公告

2023-08-23招标预告-需求广东 - 广州市 关注

基本信息

项目名称 肿瘤基因高通量测序(NGS)项目
省份/直辖市 广东 所属地区 广州市
采购单位 广州医科大学附属肿瘤医院 项目联系方式
更多联系方式 189****2188 137****9931 020-****3611 更多联系方式(5个)
以上信息为大数据平台自动计算结果,如有误差以正文为准

正文

各(潜在)供应商(即报价人) :

广州医科大学附属肿瘤医院现对 肿瘤基因高通量测序( NGS)项目 进行市场调研,欢迎符合资质条件的供应商参与。

一、采购项目名称: 肿瘤基因高通量测序( NGS)项目

二、项目内容及要求:

1. 供应商应对所有的调研内容进行响应,不允许只对部分内容进行响应。

2. 项目概况:

序号

项目内容

检测技术

项目要求

期限

1

泛实体瘤检测项目

NGS

见附件 1

1年

2

肺癌检测项目

NGS

见附件 1

1年

3

神经系统肿瘤检测项目

NGS

见附件 1

1年

4

淋巴造血系统肿瘤检测项目

NGS

见附件 1

1年

5

消化系统肿瘤检测项目

NGS

见附件 1

1年

6

其他系统肿瘤基因检测项目

NGS

见附件 1

1年

3. 项目类别:服务类。

三、响应供应商资质要求:

1. 报价人应具备《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的条件。

2. 报价人具有可独立承担民事责任能力并在中华人民共和国境内(港澳台地区除外)注册的法人单位。

3. 具有完善的冷链运输和售后服务体系 。

4. 本项目不接受联合体报价。

四、符合资格的供应商应当在 2023年 8 月 24 日至 2023年 8 月 31 日(工作日上午 8:00-12:00和下午14:30-17:00时,法定节假日除外)到 广州医科大学附属肿瘤医院医务科 递交报价响应文件, 报价响应文件必须包含以下内容 :

1. 有效的法人执照(或证明)副本、组织机构代码证、税务登记证(国税、地税)复印件或三证合一证明文件复印件证明,分公司报价的,必须提供由具有法人资格的总公司授权原件;

2. 对采购内容要求的样本、技术及服务响应;

3. 提供本项目采购内容的报价清单。报价须列明报价构成,例如:检验费、材料费、设备使用费、必须的辅助材料费、系统对接费用、全额含税发票、雇员费用、合同实施过程中应预见或不可预见费等。所有相关清单须加盖投标人公章。

五、无效报价响应文件

如发生下列情况之一的,视为无效报价,其响应视为无效:

1. 报价文件逾期送达的;

2. 不符合报价文件规定资格要求;

3. 报价响应文件有应盖而未盖公章;

4. 报价文件中对技术、功能及服务要求响应不完全的;

5. 报价人的报价明显低于其他通过符合性审查报价人的报价,有可能影响产品质量或者不能诚信履约的,该报价人不能合理说明原因并提供证明材料的;

6. 报价响应文件关键内容字迹模糊、无法辨认的;

7. 报价响应文件含有采购人不能接受的附加条件的;

8. 提供虚假材料的;

9. 不符合法律、法规规定的其他实质性要求的。

六、本次项目调研公告等相关信息***网站上公布 ,并视为有效送达,不再另行通知。本项目不举行集中答疑会,如有任何疑问请以书面形式提交采购人释疑。采购人对本采购事宜拥有最终解释权。

七、报价响应文件递交截止时间: 2023年 8 月 31 日 17 时 00 分 (注: 9 时 00 分开始受理响应文件 )

八、本次调研仅用于了解市场情况,不产生成交供应商。

九、报价响应文件送达地点:广州医科大学附属肿瘤医院医务科。

十、采购人的名称、地址和联系方式:

采购人名称:广州医科大学附属肿瘤医院

采购人地址:广州市越秀区横枝岗路 78号

联系人:梁老师

联系方式:( 020)66673666-3739

广州医科大学附属肿瘤医院

医务科

2023年 8 月 23 日

附件

1. 项目内容及要求

2. 报价表

附件 1 项目内容与要求

1.1 泛实体瘤基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1、 泛实体瘤基因检测(组织,基因数 ≤200)

1 、靶向治疗相关基因: NTRK1/2/3,FGFR1/2/3/4,BRCA1, BRCA2, ATM, CDK12, CHEK2, PPP2R2A, BRIP1, BARD1, CHEK1, FANCL, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D 和RAD54L等

2 、化疗用药相关基因:包括不限于 IDH2,XRCC1,TP53,ERCC2,MDM2,TYMS,BRCA,UGT1A1等 3 、遗传风险基因:包括不限于 ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等

4 、可检测 CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11 等免疫疗效预测生物标志物

5 、 可检测突变类型有点突变 (SNV)、插入缺失突变(Inde l )、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)。

6 、平均测序深度:组织 ≥ 9 00X

2、 泛实体瘤基因检测(血液,基因数 ≤200)

1 、靶向治疗相关基因: NTRK1/2/3,FGFR1/2/3/4,BRCA1, BRCA2, ATM, CDK12, CHEK2, PPP2R2A, BRIP1, BARD1, CHEK1, FANCL, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D 和RAD54L等

2 、化疗用药相关基因:包括不限于 IDH2,XRCC1,TP53,ERCC2,MDM2,TYMS,BRCA,UGT1A1等 3 、遗传风险基因:包括不限于 ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等

4 、可检测 CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物

5 、 可检测突变类型有点突变 (SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)。

6 、 平均测序深度:血液 ≥ 3000X

3 、 泛实体瘤基因检测(组织, 200<基因数 ≤5 00)

1、检测覆盖靶向相关基因: AKT1/2/3、ALK、AR、BRAF、KRAS、ESR1、IGF1R、MTOR、NF1/2、PTCH1、PTEN、PTPN11、FGFR1/2/3/4、DDR2、MAP2K1/2、BRCA1/2、FLT3/4、ROS1、NTRK1/2/3、TSC1/2、HGF、HRAS、SMO等

2、检测覆盖免疫治疗相关基因:IFNGR1、JAK1/2、STK11、B2M、DNMT3A、MDM2/4、TP53、POLD1、POLE等 3、遗传风险基因: ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等

4 、可检测突变类型有点突变 (SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB、MSI

5 、可检测包含肿瘤突变负荷( TMB)及MMR相关基因,提示免疫治疗疗效。

6 、平均测序深度:组织 ≥ 4 50X

4 、 泛实体瘤基因检测(血液, 200<基因数 ≤5 00)

1、检测覆盖靶向相关基因:AKT1/2/3、ALK、AR、BRAF、KRAS、ESR1、IGF1R、MTOR、NF1/2、PTCH1、PTEN、PTPN11、FGFR1/2/3/4、DDR2、MAP2K1/2、BRCA1/2、FLT3/4、ROS1、NTRK1/2/3、TSC1/2、HGF、HRAS、SMO等

2、检测覆盖免疫治疗相关基因:IFNGR1、JAK1/2、STK11、B2M、DNMT3A、MDM2/4、TP53、POLD1、POLE等 3、遗传风险基因: ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等

4 、可检测突变类型有点突变 (SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB、MSI

5 、可检测包含肿瘤突变负荷( TMB)及MMR相关基因,提示免疫治疗疗效。

6 、平均测序深度:血液 ≥ 3 000X

5 、 泛实体瘤基因检测(组织,基因数> 500)

1、可检测肿瘤靶向治疗基因,包括且不限于:EGFR、KRAS、BRAF、ALK、ROS1、MET、RET、ERBB2、NRAS、KIT、PDGFRA、BRCA1/2等。

2、可检测DDR,HRR,MMR等DNA损失修复相关基因

3、可检测微卫星不稳定(MSI)状态

4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物

5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB

6、平均测序深度:组织≥ 900X

6 、 泛实体瘤基因检测(血液,基因数> 500)

1、可检测肿瘤靶向治疗基因,包括且不限于:EGFR、KRAS、BRAF、ALK、ROS1、MET、RET、ERBB2、NRAS、KIT、PDGFRA、BRCA1/2等。

2、可检测DDR,HRR,MMR等DNA损失修复相关基因

3、可检测微卫星不稳定(MSI)状态

4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物

5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB

6、平均测序深度:血液≥ 3000X

1.2 肺癌基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1、 肺癌基因检测(组织,基因数 ≤50)

1、可检测基因包含且不限于:ALK,BRAF,EGFR, KRAS, ROS1 等。 2 、可检测 MET、RET、NF1、NRAS、MEK1、PIK3CA、PTEN、AKT1等。 3、可检测基因融合如ALK、RET、ROS1等基因和c-MET跳读变异等

4 、可开放式检测 ALK、ROS1基因融合,包括但不限于(EML4,KIF5B等)在内的所有融合伴侣基因及所有突变亚型。

5 、可开放式检测 HER2 基因20外显子插入突变,包括所有突变类型。

6 、平均测序深度: 组织 ≥5 00X

2、肺癌基因检测(血液,基因数≤50)

1、可检测基因包含且不限于:ALK,BRAF,EGFR, KRAS, ROS1 等。 2 、可检测 MET、RET、NF1、NRAS、MEK1、PIK3CA、PTEN、AKT1等。 3、可检测基因融合如ALK、RET、ROS1等基因和c-MET跳读变异等

4 、可开放式检测 ALK、ROS1基因融合,包括但不限于(EML4,KIF5B等)在内的所有融合伴侣基因及所有突变亚型。

5 、可开放式检测 HER2 基因20外显子插入突变,包括所有突变类型。

6 、平均测序深度:血液 ≥4 000X

3 、 肺癌基因检测(组织, 50<基因数≤200)

1、检测肺癌靶向药物相关基因,包括且不限于AKT1、ALK、ARAF、ATM、BRAF、BRCA1、BRIP1、CDK4、CDKN2A、CHEK2、EGFR、HER2、FGFR1/3、HRAS、IDH1/2、KIT、KRAS、MAP2K1(MEK1)、MET、PIK3CA、PTEN、RET、ROS1、SMARCB1、TP53、TSC1/2等

2 、检测化疗药物相关基因,包括且不限于 CDA、CYP2B6、CYP2C19、DPYD、ERCC1/2、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MTHFR、NQO1、TP53、TPMT、TYMS等

3 、可检测用于明确肺癌患者的分子分型。

4 、平均测序深度:组织 ≥1000x

4、 肺癌基因检测(血液, 50<基因数≤200)

1、检测肺癌靶向药物相关基因:AKT1、ALK、ARAF、ATM、BRAF、BRCA1、BRIP1、CDK4、CDKN2A、CHEK2、EGFR、HER2、FGFR1/3、HRAS、IDH1/2、KIT、KRAS、MAP2K1(MEK1)、MET、MTOR、NF1、NRAS、NTRK1/3、PDGFRA、PIK3CA、PTEN、RET、ROS1、SMARCB1、TP53、TSC1/2等

2 、检测化疗药物相关基因: CDA、CYP2B6、CYP2C19、DPYD、ERCC1/2、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MTHFR、NQO1、TP53、TPMT、TYMS、UGT1A1、XRCC1等

3 、可检测用于明确肺癌患者的分子分型。

4 、平均测序深度:血液 ≥5000x;

1.3 神经系统肿瘤基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1、 脑胶质瘤基因检测(组织,基因数 ≥6)

1 、用于分子分型的基因,包括且不限于: IDH1、IDH2、TERT、BRAF、TP53、CDKN2A、CDKN2B、EGFR、1p19q等

2 、用于用药指导的基因需包括: MGMT甲基化

3 、用于预后评估的基因需包括且不限于: IDH1、IDH2、TERT、1 p19q 等

4 、可检测包含 IDH1/IDH2点突变、1p19q联合缺失、TERT点突变 、MGMT启动子甲基化、BRAF点突变、HIST1H3B/H3F3A点突变

5、 平均测序深度:组织 ≥1000x

2、 脑胶质瘤基因检测(血液,基因数 ≥6)

1 、用于分子分型的基因,包括且不限于: IDH1、IDH2、TERT、BRAF、TP53、CDKN2A、CDKN2B、EGFR、1p19q等

2 、用于用药指导的基因需包括: MGMT甲基化

3 、用于预后评估的基因需包括且不限于: IDH1、IDH2、1p19q、TERT等

4 、可检测包含 IDH1/IDH2点突变、1p19q联合缺失、TERT点突变 、MGMT启动子甲基化、BRAF点突变、HIST1H3B/H3F3A点突变

5、平均测序深度:血液≥1000x

3、 中枢神经系统肿瘤基因检测(组织,基因数 ≥1 00 )

1 、 可检测分型及预后相关基因: 1p19q、CDKN2B、MYB、H3F3A、APC、EGFR、MYC、TERT、ATRX、FGFR1、BAP1、FGFR2、HRAS、NF1、FGFR3、IDH1、NF2 、 BRAF、FGFR4、IDH2、NOTCH1、RELA、CDKN2A、KRAS、NRAS等;

2 、可检测药物治疗相关基因: IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、 BRCA1、BRCA2、GSTT1、GSTP1、MDM2、IDH1、MGMT、IDH2等。

3 、可检测 TMB、MSI
4 、可检测遗传风险基因: NF1、ALK、APC、ATM、ATR、AXIN2、BAP1、BARD1、BLM、BMPR1A、BRAF、BRCA1、BRCA2等

5、 平均测序深度:组织 ≥1000x

4、 中枢神经系统肿瘤基因检测(血液,基因数 ≥1 00 )

1 、可检测分型及预后相关基因: 1p19q、CDKN2B、MYB、H3F3A、APC、EGFR、MYC、TERT、ATRX、FGFR1、BAP1、FGFR2、HRAS、NF1、FGFR3、IDH1、NF2 、 BRAF、FGFR4、IDH2、NOTCH1、RELA、CDKN2A、KRAS、NRAS等;

2 、可检测药物治疗相关基因: IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、 BRCA1、BRCA2、GSTT1、GSTP1、MDM2、IDH1、MGMT、IDH2等。

3 、可检测遗传风险基因: NF1、ALK、APC、ATM、ATR、AXIN2、BAP1、BARD1、BLM、BMPR1A、BRAF、BRCA1、BRCA2等
4 、可检测 TMB、MSI

5、 平均测序深度:血液 ≥1000x

5 、 脑肿瘤基因检测(组织,基因数 ≥1 00 )

1 、可检测分子分型的基因: IDH1、IDH2、ATRX、TP53、EGFR、RELA、YAP1、MYB、NF2、AKT1、SMO、TRAF7、KLF4、PIK3CA、POLR2A、CDKN2A、CDKN2B、SMARCE1、TERT、BRAF、H3F3A、1p19q

2 、可检测遗传风险相关基因: NF1、NF2、PTEN、DMD、TP53、PTCH1、SUFU、VHL、SMARCB1、SMARCE1、ALK、APC等
4 、可检测用药指导的基因: IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、MTHFR、GSTP1、SOD2、XRCC1、CYP2C19、MET、CDK6、KRAS、H3F3A、BRAF等
5 、用于免疫治疗的基因需包括: MSI、M MR 、 T MB

6 、 平均测序深度:组织 ≥1000x

6 、 脑肿瘤基因检测(血液,基因数 ≥1 00 )

1 、可检测分子分型的基因: IDH1、IDH2、ATRX、TP53、EGFR、RELA、YAP1、MYB、NF2、AKT1、SMO、TRAF7、KLF4、PIK3CA、POLR2A、CDKN2A、CDKN2B、SMARCE1、TERT、BRAF、H3F3A、1p19q等

2 、可检测遗传风险相关基因: NF1、NF2、PTEN、DMD、TP53、PTCH1、SUFU、VHL、SMARCB1、SMARCE1、ALK、APC等
4 、可检测用药指导的基因: IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、MYC、ABCB1、TP53、MTHFR、GSTP1、XRCC1、CYP2C19、MET、CDK6、KRAS、H3F3A、BRAF等
5 、用于免疫治疗的基因需包括: MSI、M MR 、 T MB

6 、 平均测序深度:血液 ≥1000x

1.4 淋巴造血系统肿瘤基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1 、 血液肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数 ≥1 00 )

1、可检测染色体结构异常

2 、可检测单碱基突变,小片段插入 /缺失,拷贝数变异和重要基因重排,重排相关重要内含子区域重点覆盖,包括MYC、BCL2、BCL6、CCND1等。

3 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

2 、 髓系肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数 ≥8 0 )

1 、可检测诊断相关基因: ABL1、EZH2、NRAS、SRSF2、ASXL1、FGFR1、STAG2、BCR、IDH1/2、TET2、CALR、JAK2/3、PDGFRB、TP53、CBFB、KIT、MYH11、RUNX1、CEBPA、MPL、RARA、DNMT3A、NF1、SETBP1、ETV6等

2 、可检测治疗相关基因: ABL1、PDGFRA、BCL2、PDGFRB、BCR、PML、CSF3R、RARA、FGFR1、SMO、FLT3、SRC、JAK1/2、TET2、IDH1/2、STAT3、KIT、TP53、NPM1、XPO1等

4 、可检测点突变、插入缺失突变、拷贝数变化等多种类型突变。

5 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

3 、 多发性骨髓瘤基因检测(组织、血液,基因数 ≥7 0 )

1、可检测诊断相关基因:APC、FGFR3、NF1、ARID1A、NRAS、BRAF、KDM5C、PIK3CA、BRCA2、KDR、PTPRD、CCND1、KRAS、RB1、CCND3、MAF、SETD2、CHD8、MAFB、SPEN、A、TP53、FANCA、TRAF3、FAT1/4 等

2 、可检测治疗相关基因: BRAF、CDK4/6、CREBBP、EP300、FGFR3、IDH1/2、KRAS、NFKB1/2、NFKBIA、NRAS

3 、 平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

4 、 B细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥1 00 )

1 、可检测单碱基突变,小片段插入 /确实,基因扩增和重要基因融合等

2 、可检测诊断关键基因: B2M、CREBBP、MEF2B、BCL2、CXCR4、MYC、BCL6、EP300、MYD88、BRAF、EZH2、NOTCH2、CARD11、GNA13、PAX5、CCND1、ID3、SPEN、CD79A、KMT2C、TNFAIP3、CCND2、IRF4、TCF3、CD79B、KMT2D、TP53等

3 、可检测治疗基因: BCL2、MAP2K1、BCL6、MTOR、BIRC3、MYD88、BTK、CXCR4、PLCG2、SYK、STAT3、LYN、TP53、MALT1等。

4 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

5 、 T细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥1 00 )

1、可检测诊断相关基因:ALK、KDM6A、STAT5B、APC、KIT、STAT6、BCOR、MAP2K1、TET2、CD28、NPM1、TP63、DDX3X、PDGFRA、FLT3、PDGFRB、IDH1、IDH2、SETD2、IL7R、STAT3、IDH2等

2 、可检测指导治疗基因: ALK、IDH1、ARID2、IDH2、B2M、KMT2C、BRAF、MTOR、、NRAS、EP300、PIK3CA、STAT3、EZH2、SMO、TP53等。

3 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

1.5 消化系统肿瘤基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1、 肠癌基因检测(组织、血液,基因数 ≥2 0 )

1 、可检测靶向药物基因: KRAS , AKT1 , MET , APC , NRAS , ALK , MLH1 , SMAD4 , BRAF , CDKN2A , PIK3CA , ERBB2 , EGFR , PTEN , STK11 , NTRK1 , FBXW7 , TP53 , DDR2 , NTRK3 等

2 、 可检测 RAS基因(包括KRAS、NRAS、HRAS)及BRAF基因外显子,预测EGFR单抗类药物(如西妥昔单抗)疗效,提示疗效信息

3 、平均测序深度:组织 ≥500X ,血液 ≥ 1000X

2、 胃癌基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0 )

1 、可检测基因 BRAF,ERBB2,NTRK1,NTRK3

3 、可检测 胃癌潜在药物靶点基因: ATM,FGFR3,NRAS,CTNNB1,KRAS,PIK3CA,EGFR,MAP2K1,PTEN,ERBB4,MET,TP53,FGFR2,NF1等

4 、可检测 MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效;

5 、可检测 HER2基因变异信息(基因扩增/突变),预测患者是否能从抗HER2治疗中获益

6、 平均测序深度:组织 ≥500X ,血液 ≥ 1000X

3、 肝胆肿瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 30 )

1 、可检测 肝癌用药 相关基因: AKT1, FGFR2,KIT,MET,NTRK3,RET,ALK,CTNNB1,FGFR3, MLH1,SMAD4,ATM,EGFR,FGFR4,KRAS,NF1,PIK3CA,STK11,BRAF,ERBB2, MAP2K1,NRAS,PTEN,TP53,FGFR1,KDR,MAPK1,NTRK1,RB1等

2 、可检测血管生成相关基因所有变异信息( FGFR、VEGFA基因扩增、突变等)

3 、 平均测序深度:组织 ≥500X ,血液 ≥ 1000X

4、 胃肠间质瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0 )

1、基因数≥ 20 个

2 、检测 NCCN/CSCO指南/国内共识推荐基因:KIT,BRAF,PDGFRA,NF1,NTRK1,FGFR1,NTRK3,FGFR2,KRAS,FGFR3,PIK3CA
3 、可检测基因 APC,PTEN,CDKN2A,RB1,CTNNB1,TP53,HRAS,NRAS,MET等

4、平均测序深度:组织≥500X ,血液 ≥ 1000X

1.6 其他系统肿瘤基因检测项目

项目名称

技术参数要求

1、甲状腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥ 16 )

1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效

2 、可检测 ALK、NTRK1/2/3、AKT1、BRAF、CD274、EGFR、PIK3CA、HRAS、PTEN、KRAS、ROS1、KIT、RET、MET、NRAS等基因突变信息,指导靶向用药

3 、可检测 BRCA1、TP53、TUBB3、XRCC1、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH11、MDM2、STMN1、TOP2A等基因突变,预测化疗药物毒副作用

4 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

2、 乳腺癌基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0

1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2 、可检测 HER2基因变异信息(基因扩增/突变),预测患者是否能从抗HER2靶向治疗中获益
3 、可检测 PI3K-mTOR信号通路相关基因,预测患者是否能从依维莫司治疗中获益
4 、可检测 BRCA1/2突变,预测患者是否能从PARP抑制剂中获益
5 、可检测 ER(雌激素受体)的突变信息,预测患者是否能从内分泌治疗中获益
6 、可检测乳腺癌常见信号通路 PI3K-mTOR与MAPK,明确原发与继发耐药机制,提供进一步靶向治疗方案

7 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

3、 妇科肿瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 70 )

1、 可检测微卫星区域和 MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效

2 、可检测 BRCA1/2基因以及HRR通路ATM、PALB2等基因,预测患者是否能从PARP抑制剂中获益
3 、可检测子宫内膜癌分子分型分子 POLE突变、微卫星不稳定MSI状态和TP53突变,指导子宫内膜癌分型和预后
4 、可检测 BRCA1/2、MTHFR、NQO1、CDA、TOP1、CYP2B6、TOP2A、DPYD、TP53、ERCC1、ERCC2、TYMS、GSTP1、XRCC1、GSTM1、UGT1A1、GSTT1、MDM2等基因

5 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

4、 黑色素瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 50 )

1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2 、可检测 ALK、NF2、RET、AKT1、NOTCH1、ROS1、AKT2、NRAS、BRAF、NTRK1/2/3、PD-L1、HRAS、PTEN、KIT、KRAS、PD- 3 、 MEK1、NF1等基因突变信息,指导靶向用药
4 、可检测 BRCA1/2、STMN1、TP53、ERCC1/2、TUBB3、XRCC1、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MGMT、RET等基因突变,预测化疗药物毒副作用

5 、 平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

5、 肉瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 500 )

1、检测肉瘤相关基因全外显子和融合相关重要内含子、骨肉瘤相关融合基因、融合伴侣及突变信息,辅助骨肉瘤诊断和分子分型

2 、可检测分子分型及预后相关基因: ALK、CDKN2A、GLI1、IDH1、NCOA2、NTRK2、PAX7、RB1、SMARCB1、TFE3、YWHAE、APC、CDKN2B、EED、FEV、GNAS、IDH2、NF1、NTRK3、PDGFB、ROS1、SRF、TP53、ZC3H7B、ATF1、CIC、ERG、FGFR1、H3F3A、KIT、NF2、NUTM1、PDGFRA、SDHA、SS18、TSC2、ATIC、CITED2、ETV1、FGFR4、H3F3B、KRAS、NFATC2等
3 、可检测 TMB、MSI/MMR 及其他免疫疗效相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2等,指导免疫治疗
4 、 平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X 。

6、 前列腺癌基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 65 )

1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效;
2 、可检测 AR(雄激素受体基因)的突变信息,明确原发与继发耐药,及时更换治疗方案;
3 、可检测 BRCA1/2所有外显子及重要内含子区域、单核苷酸变异、小片段插入缺失、大片段重排,预测PARP抑制剂疗效

4 、可检测其他靶向相关基因: AKT1、PPP2R2A、ATM、PTEN、BARD1、FGFR1、RAD51B、BRAF、FGFR2、RAD51C、KRAS、RAD51D、NRAS、RAD54L、BRIP1、NTRK1/2/3、RET、CHEK1、TP53、CDK12、ROS1、CHEK2、PALB2、EGFR、PIK3CA等
5 、可检测 ERCC1/2、GSTP1、UGT1A1、XRCC1、TP53、GSTM1、GSTT1等化疗药物代谢及毒副作用相关基因,预测化疗疗效

7 、平均测序深度:组织 ≥1000X,血液≥5000X

附件 2. 报价表

内容名称

序号

项目名称

包含基因数

(个)

项目报价

(单例 /元)

泛实体瘤基因检测项目

1

泛实体瘤基因检测(组织,基因数 ≤200)

2

泛实体瘤基因检测(血液,基因数 ≤200)

3

泛实体瘤基因检测(组织, 200<基因数 ≤5 00)

4

泛实体瘤基因检测(血液, 200<基因数 ≤5 00)

5

泛实体瘤基因检测(组织,基因数> 500)

6

泛实体瘤基因检测(血液,基因数> 500)

肺癌基因检测项目

1

肺癌基因检测(组织,基因数 ≤50)

2

肺癌基因检测(血液,基因数 ≤50)

3

肺癌基因检测(组织, 50<基因数≤200)

4

肺癌基因检测(血液, 50<基因数≤200)

神经系统肿瘤基因检测项目

1

脑胶质瘤基因检测(组织,基因数 ≥6)

2

脑胶质瘤基因检测(血液,基因数 ≥6)

3

中枢神经系统肿瘤基因检测(组织,基因数 ≥1 00 )

4

中枢神经系统肿瘤基因检测(血液,基因数 ≥1 00 )

5

脑肿瘤基因检测(组织,基因数 ≥1 00 )

6

脑肿瘤基因检测(血液,基因数 ≥1 00 )

淋巴造血系统肿瘤基因检测项目

1

血液肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数 ≥1 00 )

2

髓系肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数 ≥8 0 )

3

多发性骨髓瘤基因检测(组织、血液,基因数 ≥7 0 )

4

B细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥1 00 )

5

T细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥1 00 )

消化系统肿瘤基因检测项目

1

肠癌基因检测(组织、血液,基因数 ≥2 0 )

2

胃癌基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0 )

3

肝胆肿瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 30 )

4

胃肠间质瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0 )

其他系统肿瘤基因检测项目

1

甲状腺癌基因检测(组织、血液,基因数 ≥ 16 )

2

乳腺癌基因检测 (组织、血液,基因数 ≥2 0 )

3

妇科肿瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 70 )

4

黑色素瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 50 )

5

肉瘤基因检测 (组织、血液,基因数 ≥ 500 )

6

前列腺癌基因将按此 (组织、血液,基因数 ≥ 65 )

报价单位:(盖章)

报价时间: 2023年 月 日

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本公告地址:https://www.120bid.com/view/2114/lCICIYoBejfXyu882GcR.html

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