关于开展"两个黎药全基因组图谱开发及多组研究项目的征集公告

一、委托背景与目标

为深入挖掘与保护海南黎族特色药用植物资源，阐明其药效物质基础的遗传学依据，推动黎药新品种培育、质量标准化及产业发展，我院拟启动两个关键黎药物种的全基因组图谱绘制及多组学整合分析研究。该项目旨在获得染色体级别的高质量参考基因组，并通过重测序、转录组及代谢组学分析，揭示其遗传多样性、基因功能及活性成分合成通路。

二、服务内容与技术标准

承接方需为我院提供以下全流程技术服务：

（一）基因组De Novo测序与组装

1.物种1（基因组预估1.4G）：

采用PacBio Revio平台进行HiFi测序（≥70G Raw Data）。采用Nanopore PromethION平台进行超长测序（≥3个cell Raw Data）。完成基因组Survey评估、T2T水平组装与挂载、全套基因组注释（重复序列、基因结构、功能）。进行Hi-C辅助染色体拼接（挂载率>90%）、比较基因组学及高级分析。

2.物种2（基因组预估5G）：采用Nanopore PromethION平台进行测序（≥10G Raw Data）。完成ONT-only基因组组装、注释、Hi-C染色体挂载及比较基因组学分析。

（二）多组学整合分析

1.重测序：对物种1提供的100个样本进行DNA提取与测序，各产生30G数据，进行群体遗传学分析。

2.转录组：对两个物种各24个样本进行常规转录组测序，每个样本产生6G数据。

3.靶向代谢组：对两个物种各24个样本进行靶向代谢组学检测与分析。

（三）数据交付与成果

1.交付成果：完整的项目《结题报告》、全部原始测序数据（FastQ格式）及分析结果。

2.交付方式：线上交付。

3.知识产权：项目所产生的全部技术成果，包括但不限于论文署名权、专利申请权、后续开发利用权等，归三亚市中医院所有。

三、对承接方的资格与能力要求

1.***平台：必须具备成熟的PacBio Revio、Nanopore PromethION、DNBSEQ等主流三代、***平台，并拥有丰富的动植物基因组De Novo组装经验。

2.专业能力：拥有强大的生物信息学团队，能够独立完成T2T级别基因组组装、多组学整合分析及各类高级生物信息学分析。

3.项目经验：拥有类似规模的药用植物基因组项目成功案例，能应对高杂合、高重复基因组的技术挑战。

4.质量保障：能够明确承诺本合同第二条所列的各项技术指标（如N50、BUSCO、Mapping Rate等）。

四、服务要求与流程管理

1.项目周期：自合同签订之日起12个月内完成全部工作并交付成果。

2.沟通机制：承接方需指定固定的项目负责人，与我院项目联系人建立定期沟通机制，按月汇报项目进展。

3.样品管理：承接方需对样品进行规范检测，对不合格样品需及时沟通确认，并明确后续处理方式及费用。

4.保密义务：承接方须对项目所有数据、资料及成果承担保密责任，保密期限自合同生效起不少于5年。

5.档案管理：建立完整的项目服务档案，确保所有实验记录、数据、沟通文书可追溯。

五、项目预算

1.项目预算：本项目限价（￥288,000.00）。

报名须知

（一）报名截止时间：2025年12月1日-5日17:30（5个工作日）

（二）报名所需材料：（需密封）

1、提供类似规模的药用植物基因组项目成功案例

1、报价单加盖鲜章。

2、法定代表人的有效身份证复印件加盖鲜章。法定代表人委托代理人参加的，须提供法定代表人授权书原件及法定代表人委托代理人的有效身份证件复印件加盖鲜章。

3、有效独立法人的营业执照（三证合一）复印件加盖鲜章。

4、联系人姓名，联系方式。

七、报名方式

（一）邮寄报名地点：****楼科教科

八、联系方式

联系人：白老师

联系电话：136****3630

三亚市中医院

2025年12月1日