长沙市中心医院：二代基因测序仪平台采购需求公开

一、功能及要求：

一、设备名称： ***平台

二、采购预算金额 ： 3500000元

三、技术参数及要求

1. ***平台主要内容：

1.1. 二代基因测序仪：主要用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查等临床应用，可开展全基因组测序、全外显子测序、宏基因组测序、单细胞测序等科研应用。

1.2. 自动化样本制备系统：包括组织标本和血液标本项目自动化样本制备系统。

1.3. 文库构建系统：用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查等应用的文库构建。

1.4. 生物信息分析系统：包括各类数据分析、实验室管理等方面的应用。

1.5. 其他辅助设备：满足实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序等实验过程需求的整套辅助设备。

1.6. 售后服务：***平台，***平台设备及技术服务设计，共同建立医院的二代测序能力，为医院完成早期筛查、精准诊断、用药监控、疗效监测等方面的应用落地提供设备及技术支持。***平台自主进行实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序，实现相关的临床研究及应用。

1.7. 多人阅览系统：用于肿瘤基因检测的临床诊断质控、教学。

2. ***平台主要设备及主要辅助设备技术参数

2.1. 二代高通量测序仪技术参数

2.1.1. ▲有NMPA医疗器械注册证，临床注册适用范围包含NIPT、肿瘤等多种应用。

2.1.2. ▲测序技术：桥式扩增成簇，边合成边测序（SBS）。

2.1.3. ▲测序的模板扩增过程为自动化，无需手工操作，且在同一台仪器上完成，无需配置额外的设备。

2.1.4. 测序数据通量可选择两种通量的测序芯片：高通量芯片每次运行可生成 ≥400M条片段序列120G碱基数据；中通量芯片每次运行可生≥130M条片段序列39G碱基数据。

2.1.5. 使用双色荧光系统进行碱基识别，以提高测序速度。

2.1.6. 单张测序芯片有 ≥4个流道。

2.1.7. 自动化双端读取序列，读长最长为 2x150个碱基。

2.1.8. 以 Q30为测序质量标准（即每个碱基的准确度为99.9％），标准品Phix在2X75测序模式下，80%以上的碱基比例可达到Q30，2X150测序模式下，75%以上的碱基比例可达到Q30。

2.1.9. 可精确读取不少于 12个连续单个重复碱基。

2.1.10. 测序时间需满足 75循环测序时间低于12小时，300循环测序时间可低于26小时。

2.1.11. 测序通量需满足每 24小时可产出不少于100Gb数据量。

2.1.12. 运行环境条件需满足温度： 19℃～25℃；相对湿度：20～80%。

2.2. 自动化样本制备系统主要技术参数

自动化样本制备系统用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查前期的核酸提取（包括各类 DNA、RNA提取）。可单次自动处理单个样本不造成浪费。

2.2.1. 仪器可全自动完成样品裂解、裂解液转移、核酸结合、磁珠清洗、洗脱液转移至 1.5ml收集管等实验步骤的全自动操作，无需人工介入。石蜡组织可以直接自动脱蜡，提取物可用于扩增、检测及基因分析。

2.2.2. ▲样本处理量：可自由选择1-24个样本操作，不会浪费试剂条。

2.2.3. 程序运行：采用枪头移液式及枪头内吸磁法运行，枪头内做磁珠与液体分离。

2.2.4. 核酸提取得率： 200μl 新鲜全血可提取6μg以上的DNA；2ml新鲜全血可提取6μg以上的RNA。

2.2.5. 核酸提取纯度： DNA A260/A280为1.7-1.9、RNA A260/A280为1.8-2.0。

2.2.6. 核酸洗脱体积可以选择 30ul，60μl，100μl，150μl或200μl。

2.2.7. 安全防护：封闭式工作站，带有安全保护门，紫外灯灭菌达到分子生物学实验要求。

2.2.8. 内置加热块：室温 ~100℃，可进行样本的加热裂解和核酸的洗脱温育。

2.2.9. ▲处理样本：全血、动物组织、细菌、培养细胞、植物、病毒、血清血浆、无细胞体液、拭子、石蜡包埋组织、尿液等。可根据实验需求，可以选择相应样本的DNA/RNA提取试剂盒，并可以提供DNA、RNA共提试剂盒。

2.2.10. 移液精度：转移体积 <100μl，误差范围≤10%；转移体积>100μl，误差范围≤4%。

2.2.11. ≥7英寸彩色触控屏幕。

2.2.12. 设备拥有 24根移液头，可一次提取1-24 任意数量的样本。

2.2.13. 采用非石墨枪头。

2.2.14. 石蜡样本可以直接上机，机器自动脱蜡、裂解、解交联和提取。

2.3. 文库构建系统主要技术参数

文库构建系统完成 NGS文库制备、包括核酸纯化、DNA片段长度选择、样品浓度均一化、酶反应体系构建、测序反应体系构建、磁珠纯化、温控反应、文库pooling、PCR/QPCR体系构建、分液配液等仪器设备。

2.4. 生物信息分析系统

2.4.1. ▲自动本地化完成信息分析，分析结束后直接输出检测报告，所有数据分析在本实验室完成，数据不发往公司，本地化存储、分析及管理。

2.4.2. 各生信分析系统功能可支持样品管理、实验管理、数据管理、报告管理、多种临床检测应用的信息分析、权限设置。

2.4.3. 生信分析系统具备成熟的检测相关信息分析软件。

2.4.4. 提供高性能存储和计算机工作站，满足分析需求，升级性能。硬件配置不低于：

2.4.5. 数据分析系统：储存容量： ≥10000个组织（或2000个血液）样本储存数据，满足≥6年的存储容量需求。内存：≥512G；硬盘：≥300Gx2+10Tx12。

2.4.6. 报告系统：品牌工作站， CPU（i5及以上）、内存≥16G、SSD≥500G、机械硬盘≥1TB。具有二代测序中文自动分析系统，测序完自动生成分析报告，可直接打印中文版报告。

2.5. 多人阅览系统

系统适于在电源 220V（ ± 10%）/50Hz、气温5℃～40℃和最大相对湿度80%的环境条件下运行。 配置符合中国有关标准要求的插头，或提供适当的转换插座。

2.5.1. 5.1 研究级正置显微镜

2.5.1.1. 研究级正置显微镜，可作明场观察

2.5.1.2. ▲光学系统：无限远校正光学系统，齐焦距离必须为国际标准45mm

2.5.1.3. 调焦系统：载物台垂直运动方向距离不小于 25mm，带聚焦粗调限位器，粗调旋钮扭矩可调，最小微调刻度单位≤1微米

2.5.1.4. 观察镜筒：宽场三目观察筒，倾角为 30°

2.5.1.5. ▲ 照明装置：内置透射光柯勒照明器，高亮度LED(强度大于12V100W卤素灯)，配置加装色温调整滤光片。

2.5.1.6. 物镜：万能平场半复消色差物镜 4X（N.A.0.13，W.D.17）10X（N.A.0.3，W.D.10）20X（N.A.0.5，W.D.2.1）40X（N.A.0.75，W.D.0.15）

2.5.1.7. 载物台：人机工程学、右手、低位置同轴驱动选钮的高抗磨损性陶瓷覆盖层载物台。

2.5.1.8. 目镜： 10X宽视野目镜，带屈光度校准

2.5.1.9. 物镜转盘：五孔位物镜转盘

2.5.1.10. 摇摆式聚光镜： N.A.值 0.9-0.16

2.5.1.11. 十人共览光学附件

2.6. 其他辅助设备

提供满足实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序等实验过程需求的整套辅助设备，实验室不再为项目的开展而购买新的任何设备。（附录为辅助设备目录，***平台建设方案更新）

2.7. 售后服务：

2.7.1. 质保：承担整机系统（最终验收合格后）维护保修，使用配套试剂耗材期间承担该项目所有设备的质保，包含仪器维修维护所需要的所有耗材和配件，负责仪器的年度校准并出具校准报告，仪器故障后在 2小时内响应，24小时内到达现场。

2.7.2. 提供完善的实验室技术人员培训，提供仪器安装、实验室布局及技术支持等全流程实验室解决方案。

2.7.3. 仪器使用期间，提供实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序的技术支持。

2.7.4. 技术支持团队应该具有丰富的经验，***平台搭建，实验室管理经验。

2.7.5. 负责联接医院朗珈系统、 Lis系统。并承担相关接口、工作站费用。

2.7.6. 试剂及耗材符合长沙市医保政策 ，***网价格，***网价。

2.7.7. 检测项目试剂价格（包括试剂、耗材、质控品、校准品等项目所需所有材料。报价包括试剂及耗材，质控品、校准品等配套提供）＜每个项目收费价格（现行长沙市收费物价）的 50%。

附录：

NGS平台检测实验室辅助设备清单

二、相关标准：

详见采购文件

三、技术规格：

详见采购文件

四、交付时间和地点：

详见采购文件

五、服务标准：

详见采购文件

六、验收标准：

详见采购文件

七、其他要求：

详见采购文件

采购需求仅供参考，相关内容以采购文件为准。